十年动乱与南迁北返

1966年开始的文化大革命，使哈工大正常教学科研秩序受到严重破坏。

1970年春，根据上级指示，哈工大少数人员与绝大部分物资南迁重庆，与哈军工二系合并成立重庆工业大学；留哈部分与黑龙江工学院、哈尔滨电工学院合并组成新的哈尔滨工业大学。1973年8月国务院、中央军委决定重庆工大北返，恢复原哈工大。几经折腾，学校遭到严重破坏。